Можно ли купить оборудование для фирмы через сайт alibaba или другой ?
Но купить со всеми сопутствующими документами, что бы по бухгалтерии всё хорошо прошло.

Если заключите с продавцом договор. Деньги переведете не через пэйпал, а нормально через ваш и его банки.
Плюс он должен предоставить все сопроводительные документы на груз. Прислать эмейлом и вложить оригиналы.
Документы для разтаможки. В общем на таможне можно все провести как образцы, только скорее всего сумма у вас великовата, не знаю ваших законов на этот счет. Самое главное - напрячь продавца по поводу договора и документов. Ну и кроме суммы за груз плюсуйте доставку и таможенную очистку. )